NGS解析受託サービス
委託業務実施機関元 
公益財団法人かずさDNA研究所 供給元 
株式会社かずさゲノムテクノロジーズ
公益財団法人かずさDNA研究所 供給元 株式会社かずさゲノムテクノロジーズ
サービス概要
次世代シーケンサー（NGS）を使用した変異解析や発現解析などの各種受託解析を承っております。解析用途に合わせたライブラリー作製の工程のみの受託、あるいは作製されたライブラリーをお預かりしてシーケンスのみの受託も対応しております。
NGSを用いた解析を日々行っている皆様から、これからNGSの利用を考えている皆様まで、幅広くご利用いただけるサービスをご用意いたしました。なお、本サービスは、NGSを用いたゲノム解析で数多くの成果を上げているかずさDNA研究所の協力のもとで提供しております。
- ● 使用機器
- NextSeq 2000, NextSeq 500, MiSeq［イルミナ社］
PacBio Sequel, PacBio Sequel II [PacBio社] - ● １細胞NGS 解析（RNA-seq、TCR、BCR） も承っております。詳細はお問い合せください。
本サービスに関する技術記事解析メニュー サンプルは1個から承ります。
サンプル量および品質が下記リスト記載の量に満たない場合でも、解析可能な場合がございます。予めご相談ください。
＊取得データ量は目安の数値であり、それらのデータ量を保証するものではありません。
ロングリード（PacBio Sequel II & Sequel）
| 解析メニュー | 取得データ目安 | 必要サンプル量 | 納 期 | サンプル数 | 価格/1サンプル | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PacBio Sequel II | RNA | 400万 - 500万well由来のリード | Total RNA：4 μg以上（100 ng/ul以上） | 8-12週間 (4セルの場合は 8週間) |
1検体／1セル | ¥ 784,000 |
| DNA | HiFi Read：10-30Gb （HiFiデータ作成後） continuous long read:90-130Gb （DNAの品質による） |
HiFi Read：30μg以上 continuous long read：20ug以上 QC結果によりDNAに分解が見られた場合は さらに多くのDNAが必要となる場合があります。 |
8-12週間 (4セルの場合 は8週間) |
1検体／1セル | ¥ 686,000 | |
| 2検体／1セル | ¥ 736,000 | |||||
| 3検体／1セル | ¥ 786,000 | |||||
| 4検体／1セル | ¥ 836,000 | |||||
| 5検体／1セル | ¥ 886,000 | |||||
| HiFiデータ作成 （オプション メニュー） |
ー | ー | 2週間 | 1セル分 | ¥ 70,000 | |
ゲノム解析
| 解析メニュー | 取得データ目安 | 必要サンプル量 | 納 期 | サンプル数 | 価格/1サンプル |
|---|---|---|---|---|---|
| 全ゲノムシークエンス | ご依頼内容ごとに設定 | DNA：2 μg以上（100 ng/μL以上） | 4週間〜 | お問合せ | |
| Human Exome-Seq (150bp Paired-End)アジレントV6 or V7 |
4,000万リード、6Gb | DNA：2 μg以上（100 ng/μL以上） | 8週間 | ８以上の場合 | ¥ 168,000 |
発現解析
| 解析メニュー | 取得データ目安 | 必要サンプル量 | 納 期 | サンプル数 | 価格/1サンプル |
|---|---|---|---|---|---|
| 真核生物 mRNA-Seq（TypeA； 75 bp Single-Read） | 1,500万リード、1125Mb | total RNA：2 μg以上（40 ng/μL以上） | 4週間 | ８以上の場合 | ¥ 105,000 |
| 真核生物 mRNA-Seq（TypeB； 75 bp Paired-End） | 3,000万リード、2.25Gb | total RNA：2 μg以上（40 ng/μL以上） | 8週間 | ８以上の場合 | ¥ 126,000 |
| miRNA-Seq(75 bp Single-Read) | 1,500万リード、1125Mb | total RNA：4 μg以上（200 ng/μL以上） | 2〜4週間 | ８以上の場合 | ¥ 112,000 |
| 3'RNA-Seq | 100万リード | total RNA：2 μg以上（40 ng/μL以上） | 8週間 | ６以上の場合 | ¥ 51,000 |
| シングルセル3'RNA Seq | 100万リード | シングルセル | 8週間 | ８以上の場合 | ¥ 54,000 |
エピジェネティクス関連
| 解析メニュー | 取得データ目安 | 必要サンプル量 | 納 期 | サンプル数 | 価格/1サンプル |
|---|---|---|---|---|---|
| Human Bisulfite-Seq（75 bp Paired-End） | 3,000万リード、2.25Gb | DNA：4 μg以上（100 ng/μL以上） | 8週間〜 | お問合せ | |
| MBD-Seq(75 bp Paired-End) | 3,000万リード、2.25Gb | DNA：4 μg以上（100 ng/μL以上） | 8週間〜 | ８以上の場合 | ¥ 126,000 |
| ChIP-Seq（75 bp Single-Read） | ご依頼内容ごとに設定 | クロマチン免疫沈降後DNA：100 ng以上（10 ng/μL以上） | お問合せ | ||
ライブラリ調製
| 解析メニュー | 取得データ目安 | 必要サンプル量 | 納 期 | サンプル数 | 価格/1サンプル |
|---|---|---|---|---|---|
| mRNA-Seq用 | 納品物は作製済みの ライブラリーとなります。 |
total RNA：2 μg以上（40 ng/μL以上） | 3週間 | 8個の場合 | ¥ 56,000 |
| Total RNA-Seq用 | total RNA：2 μg以上（40 ng/μL以上） | 3週間 | 7以上の場合 | ¥ 84,000 | |
| Human Exome-Seq用 | DNA：2 μg以上（100 ng/μL以上） | 3週間 | 8以上の場合 | ¥ 112,000 | |
| 全ゲノム、Target-Seq用 | DNA：2 μg以上（100 ng/μL以上） | 3週間 | 8以上の場合 | ¥ 56,000 |
シーケンサーラン（レーン貸切）
| 解析メニュー | 取得データ目安 | 必要サンプル量 | 納 期 | サンプル数 | 価格/1サンプル | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| NextSeq | 75 bp Single-Read | 4億リード、最大30Gb | 4週間 | 1レーン | ¥ 402,000 | |
| 5-9レーン | ¥ 388,000 | |||||
| 10レーン以上 | ¥ 374,000 | |||||
| 75 p Paired-End Mid | 2.6億リード、最大 19.5Gb | 1レーン | ¥ 317,000 | |||
| 150 bp Paired-End Mid | 2.6億リード、最大39 Gb | ¥ 542,000 | ||||
| 75 bp Paired-End | 8億リード、最大60 Gb | ¥ 713,000 | ||||
| 150 bp Paired-End | 8億リード、最大120 Gb | ¥ 1,139,000 | ||||
| MiSeq | 150 bp Paired-End | 2,700万リード、4 Gb | 8週間 | 1レーン | ¥ 336,000 | |
| 250 bp Paired-End | 2,700万リード、6.7 Gb | ¥ 361,000 | ||||
| 300 bp Paired-End | 4,700万リード、14.1 Gb | ¥ 456,000 | ||||
| 150bp Paired-End Micro | 800万リード、1.2 Gb | ¥ 174,000 | ||||
| 150 bp Paired-End Nano | 200万リード、300 Mb | ¥ 144,000 | ||||
| 250 bp Paired-End Nano | 200万リード、500 Mb | ¥ 174,000 | ||||
| DNBSEQ-G400RS | 50 bp Single-Read | 16億リード、80 Gb | 8週間 | 1レーン | ¥ 350,000 | |
| 100 bp Single-Read | 16億リード、160 Gb | ¥ 364,000 | ||||
| 400 bp Single-Read | 16億リード、640 Gb | ¥ 1,008,000 | ||||
| 100 bp Paired-End | 32億リード、320 Gb | ¥ 560,000 | ||||
| 150 bp Paired-End | 32億リード、480 Gb | ¥ 742,000 | ||||
| 200 bp Paired-End | 32億リード、640 Gb | ¥ 903,000 | ||||
| イルミナライブラリーConversion費用 | Conversionを実施（ランは含みません） | 3週間 | 1サンプル | ¥ 14,000 | ||
● Illumina社NextSeq 500、NextSeq 2000でのランも承ります。ご希望の方はお問合せください。
ライブラリのクオリティチェック
| 解析メニュー | 納期 | サンプル量 | 価格/1サンプル |
|---|---|---|---|
| クオリティチェック（バイオアナライザー） | 1週間 | 8検体ごと | ¥ 15,000 |
| 濃度測定（定量PCR） | 1週間 | 8検体ごと | ¥ 33,000 |
抗体可変領域解析
5'-RACE法により5'UTRから定常領域までの塩基配列を取得し、シグナル配列部分の開始メチオニンから可変領域の末端部分までの配列を報告します。かずさDNA研究所では大規模cDNAプロジェクトでの経験を生かし、抗体産生細胞からRNA抽出を行い、迅速な可変領域配列の決定を行います。
| 解析メニュー | 納 期 | サンプル数 | 価格/1サンプル |
|---|---|---|---|
| 基本解析 | 3～4週間 | 1 | ¥ 350,000 |
| CDR同定 | 1～2週間 | 1 | ¥ 21,000 |
納品物
ロングリード、ゲノム解析、発見解析、エピジェネティクス関連およびランのみ（レーン貸し切り）は、Fastqファイルと作業報告書の入ったDVDまたはHDDを納品します。
ご注文の流れ
- 1お問い合わせ・お見積りフォームに必要事項を記入し送信
- 2お打ち合わせ、お見積り兼発注書・解析依頼書の受け取り
- 3販売店に発注 解析依頼書にサンプル情報を記入し送付(Email)
- 4サンプル送付(印刷した解析依頼書を同梱)
サンプル送付方法
- 必要サンプル量は各メニューの記載をご参照ください。
- サンプルは必ず抽出したDNAまたはRNAまたは調整済みライブラリ－の状態にして送りください。
細胞、組織などの状態でのサンプル受け取りはできません。 - サンプル送付前にサンプル情報を記載した解析依頼書(Excelファイル)をメールにてお送りください。
サンプル送付時にはプリントアウトした解析依頼書を同梱してください。 - データ解析のみのご依頼の場合：依頼書記載のサンプル名称と、データにご登録されている名称は統一してください。ヒトサンプルの場合は匿名化をお願いいたします。作業内容ならびにお見積もり内容の確定後にデータをご送付ください。
| サンプル | サンプルの状態 | 送付方法 |
|---|---|---|
| ゲノムDNA | TEまたは市販のDNA抽出キットの溶出液に溶解 | 保冷剤を同梱し冷凍便 |
| RNA | RNaseフリー水または市販のRNA抽出キットの溶出液に溶解 | ドライアイスを同梱し冷凍便 |
| ライブラリー | 市販のライブラリー調整キットのプロトコールに従って溶解 | 保冷剤を同梱し冷凍便 |
| 抗体産生細胞（ハイブリドーマ） | ハイブリドーマをPBS中で2回遠心し、上清を除いて速やかに冷凍したもの | ドライアイスを同梱し冷凍便 |
解析依頼書送付先： otoiawase@kazusagt.com
サンプル送付先
〒292-0818
千葉県木更津市かずさ鎌足2-6-7
株式会社かずさゲノムテクノロジーズ
Tel: 0438-52-2001
＊注意：平日に到着するようご指定ください。