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NGS解析受託サービス

業務実施機関　

公益財団法人かずさDNA研究所

サービス概要

次世代シーケンサー（NGS）を使用した変異解析や発現解析などの各種受託解析を承っております。解析用途に合わせたライブラリー作製の工程のみの受託、あるいは作製されたライブラリーをお預かりしてシーケンスのみの受託も対応しております。
NGSを用いた解析を日々行っている皆様から、これからNGSの利用を考えている皆様まで、幅広くご利用いただけるサービスをご用意いたしました。なお、本サービスは、NGSを用いたゲノム解析で数多くの成果を上げているかずさDNA研究所の協力のもとで提供しております。

● 使用機器: NextSeq 500、NextSeq2000、MiSeq［イルミナ社］
PacBio Sequel II、PacBio Sequel IIe [PacBio社]
DNBSEQ-G400RS [MGI社]
● １細胞NGS 解析（RNA-seq、TCR、BCR）も承っております。詳細はお問い合せください。

本サービスに関する技術記事

解析メニューサンプルは1個から承ります。
サンプル量および品質が下記リスト記載の量に満たない場合でも、解析可能な場合がございます。予めご相談ください。
＊取得データ量は目安の数値であり、それらのデータ量を保証するものではありません。

ロングリード（PacBio Sequel II & Sequel）

● 作業内容：クオリティチェック+ライブラリ調製＋シーケンサーラン
解析メニュー		取得データ目安	必要サンプル量	納期	サンプル数
PacBio Sequel II	RNA	400万 - 500万well由来のリード	Total RNA：4 μg以上（100 ng/ul以上）	8-12週間 (4セルの場合は 8週間)	1検体／1セル
	DNA	HiFi Read：10-30Gb （HiFiデータ作成後） continuous long read:90-130Gb （DNAの品質による）	HiFi Read：30μg以上 continuous long read：20ug以上 QC結果によりDNAに分解が見られた場合はさらに多くのDNAが必要となる場合があります。	8-12週間 (4セルの場合は8週間)	1検体／1セル
					2検体／1セル
					3検体／1セル
					4検体／1セル
					5検体／1セル
	HiFiデータ作成（オプションメニュー）	ー	ー	2週間	1セル分

ゲノム解析

● 作業内容：ライブラリ調製＋シーケンサーラン
● オプションで品質確認を希望される場合には
8サンプル毎に¥15,000の費用が発生します。
解析メニュー	取得データ目安	必要サンプル量	納期	サンプル数
全ゲノムシークエンス	ご依頼内容ごとに設定	DNA：2 μg以上（100 ng/μL以上）	4週間〜	お問合せ
Human Exome-Seq (150bp Paired-End)アジレントV6 or V7	4,000万リード、6Gb	DNA：2 μg以上（100 ng/μL以上）	8週間	８以上の場合

発現解析

● 作業内容：クオリティチェック+ライブラリ調製+シーケンサーラン
● RNA品質検査費用を価格に含みます。弊社推奨基準を満たさない場合、解析中止、もしくはサンプルの再提出をお願いすることがございます。
　品質検査は2回目までは無償で、3回目以降は8サンプル毎に¥15,000です。
解析メニュー	取得データ目安	必要サンプル量	納期	サンプル数
真核生物 mRNA-Seq（TypeA； 75 bp Single-Read）	1,500万リード、1125Mb	total RNA：2 μg以上（40 ng/μL以上）	4週間	８以上の場合
真核生物 mRNA-Seq（TypeB； 75 bp Paired-End）	3,000万リード、2.25Gb	total RNA：2 μg以上（40 ng/μL以上）	8週間	８以上の場合
miRNA-Seq(75 bp Single-Read)	1,500万リード、1125Mb	total RNA：4 μg以上（200 ng/μL以上）	8週間	８以上の場合
3'RNA-Seq	100万リード	total RNA：2 μg以上（40 ng/μL以上）	8週間	６以上の場合
シングルセル3'RNA Seq	100万リード	シングルセル	8週間	８以上の場合

エピジェネティクス関連

● 作業内容：ライブラリ調製+シーケンサーラン
● オプションで品質確認を希望される場合には8サンプル毎に¥15,000の費用が発生します。
解析メニュー	取得データ目安	必要サンプル量	納期	サンプル数
Human Bisulfite-Seq（75 bp Paired-End）	3,000万リード、2.25Gb	DNA：4 μg以上（100 ng/μL以上）	8週間〜	お問合せ
MBD-Seq(75 bp Paired-End)	3,000万リード、2.25Gb	DNA：4 μg以上（100 ng/μL以上）	8週間〜	８以上の場合
ChIP-Seq（75 bp Single-Read）	ご依頼内容ごとに設定	クロマチン免疫沈降後DNA：100 ng以上（10 ng/μL以上）		お問合せ

ライブラリ調製

● 作業内容：材料RNAのクオリティーチェック、ライブラリ調製、調製したライブラリーのクオリティーチェック（長さ、濃度）
● RNA品質検査の結果、推奨基準を満たさない場合、解析中止、もしくはサンプルの再提出をお願いすることがございます。
● オプションでqPCRによるライブラリの定量を希望される場合には8サンプル毎に¥33,000の費用が発生します。
解析メニュー	取得データ目安	必要サンプル量	納期	サンプル数
mRNA-Seq用	納品物は作製済みのライブラリーとなります。	total RNA：2 μg以上（40 ng/μL以上）	3週間	8個の場合
Total RNA-Seq用		total RNA：2 μg以上（40 ng/μL以上）	3週間	7以上の場合
Human Exome-Seq用		DNA：2 μg以上（100 ng/μL以上）	3週間	8以上の場合
全ゲノム、Target-Seq用		DNA：2 μg以上（100 ng/μL以上）	3週間	8以上の場合

シーケンサーラン（レーン貸切）

● 作業内容：シーケンサーラン
● オプションで品質確認を希望される場合には8サンプル毎に¥15,000の費用が発生します。
解析メニュー		取得データ目安	納期	サンプル数
NextSeq	75 bp Single-Read	4億リード、最大30Gb	4週間	1レーン
				5-9レーン
				10レーン以上
	75 p Paired-End Mid	2.6億リード、最大 19.5Gb		1レーン
	150 bp Paired-End Mid	2.6億リード、最大39 Gb
	75 bp Paired-End	8億リード、最大60 Gb
	150 bp Paired-End	8億リード、最大120 Gb
MiSeq	150 bp Paired-End	2,700万リード、4 Gb	8週間	1レーン
	250 bp Paired-End	2,700万リード、6.7 Gb
	300 bp Paired-End	4,700万リード、14.1 Gb
	150bp Paired-End Micro	800万リード、1.2 Gb
	150 bp Paired-End Nano	200万リード、300 Mb
	250 bp Paired-End Nano	200万リード、500 Mb
DNBSEQ-G400RS	50 bp Single-Read	16億リード、80 Gb	8週間	1レーン
	100 bp Single-Read	16億リード、160 Gb
	400 bp Single-Read	16億リード、640 Gb
	100 bp Paired-End	32億リード、320 Gb
	150 bp Paired-End	32億リード、480 Gb
	200 bp Paired-End	32億リード、640 Gb
	イルミナライブラリーConversion費用	Conversionを実施（ランは含みません）	3週間	1サンプル

● Illumina社NextSeq 500、NextSeq 2000でのランも承ります。ご希望の方はお問合せください。

ライブラリのクオリティチェック

解析メニュー	納期	サンプル量
クオリティチェック（バイオアナライザー）	1週間	8検体ごと
濃度測定（定量PCR）	1週間	8検体ごと

抗体可変領域解析

5'-RACE法により5'UTRから定常領域までの塩基配列を取得し、シグナル配列部分の開始メチオニンから可変領域の末端部分までの配列を報告します。かずさDNA研究所では大規模cDNAプロジェクトでの経験を生かし、抗体産生細胞からRNA抽出を行い、迅速な可変領域配列の決定を行います。

解析メニュー	納期	サンプル数
基本解析	3～4週間	1
CDR同定	1～2週間	1

納品物

ロングリード、ゲノム解析、発見解析、エピジェネティクス関連およびランのみ（レーン貸し切り）は、Fastqファイルと作業報告書の入ったDVDまたはHDDを納品します。

ご注文の流れ

1お問い合わせ・お見積りフォームに必要事項を記入し送信
2お打ち合わせ、お見積り兼発注書・解析依頼書の受け取り
3かずさDNA研究所からご案内の送付方法に従い、サンプルを送付

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