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NGS解析受託サービス

委託業務実施機関元  公益財団法人かずさDNA研究所 供給元  株式会社かずさゲノムテクノロジーズ

サービス概要

次世代シーケンサー(NGS)を使用した変異解析や発現解析などの各種受託解析を承っております。解析用途に合わせたライブラリー作製の工程のみの受託、あるいは作製されたライブラリーをお預かりしてシーケンスのみの受託も対応しております。
NGSを用いた解析を日々行っている皆様から、これからNGSの利用を考えている皆様まで、幅広くご利用いただけるサービスをご用意いたしました。なお、本サービスは、NGSを用いたゲノム解析で数多くの成果を上げているかずさDNA研究所の協力のもとで提供しております。

● 使用機器
HiSeq 1500, HiSeq 2500, NextSeq 500, MiSeq[イルミナ社]
PacBio Sequel [PacBio社]
● 1細胞NGS 解析(RNA-seq、TCR、BCR) も承っております。詳細はお問い合せください。

解析メニュー サンプルは1個から承ります。
サンプル量および品質が下記リスト記載の量に満たない場合でも、解析可能な場合がございます。予めご相談ください。

ロングリード(PacBio Sequel)
● 作業内容:クオリティチェック+ライブラリ調製+シーケンサーラン
解析メニュー 取得データ目安 必要サンプル量 納 期 サンプル数 価格/1式
RNA 40万 - 60万リード Total RNA:4 μg以上(100 ng/ul以上) 8週間 1 ¥ 506,000
DNA 4Gb - 7Gb(DNAの品質による) DNA: 10 μg以上(40〜50 kb以上)で4セルまで5セル以上の場合は
4セルごとに10 μgを追加してご送付ください。
QC結果によりDNAに分解が見られた場合は10 μg以上必要な場合もあります。
1サンプルを複数セルで解析する場合も10 µg以上必要な場合があります。
8週間 1検体/1セル ¥ 401,000
2検体/1セル ¥ 471,000
5検体/1セル ¥ 681,000
1検体/2セル ¥ 774,000
ゲノム解析
● 作業内容:ライブラリ調製+シーケンサーラン
● オプションで品質確認を希望される場合には8サンプル毎に¥15,000の費用が発生します。
解析メニュー 取得データ目安 必要サンプル量 納 期 サンプル数 価格/1サンプル
全ゲノムシークエンス ご依頼内容ごとに設定 DNA:2 μg以上(100 ng/μL以上) 4週間〜 お問合せ
Human Exome-Seq(100bp Paired-End) 8,000万リード、8Gb DNA:2 μg以上(100 ng/μL以上) 8週間 8の倍数 ¥ 222,000
発現解析
● 作業内容:クオリティチェック+ライブラリ調製+シーケンサーラン
● RNA品質検査費用を価格に含みます。弊社推奨基準を満たさない場合、解析中止、もしくはサンプルの再提出をお願いすることがございます。
 品質検査は2回目までは無償で、3回目以降は8サンプル毎に¥15,000です。
解析メニュー 取得データ目安 必要サンプル量 納 期 サンプル数 価格/1サンプル
真核生物 mRNA-Seq(TypeA; 50 bp Single-Read) 1,500万リード、750Mb total RNA:2 μg以上(40 ng/μL以上) 4週間 8以上 ¥ 102,000
真核生物 mRNA-Seq(TypeB; 100 bp Paired-End) 3,000万リード、3Gb total RNA:2 μg以上(40 ng/μL以上) 8週間 8以上 ¥ 154,000
miRNA-Seq(50bp Single-Read) 1,500万リード、750Mb total RNA:4 μg以上(200 ng/μL以上) 2〜4週間 8以上 ¥ 116,000
3'RNA-Seq 100万リード total RNA:2 μg以上(40 ng/μL以上) 8週間 6以上 ¥ 57,000
エピジェネティクス関連
● 作業内容:ライブラリ調製+シーケンサーラン
● オプションで品質確認を希望される場合には8サンプル毎に¥15,000の費用が発生します。
解析メニュー 取得データ目安 必要サンプル量 納 期 サンプル数 価格/1サンプル
Human Bisulfite-Seq(100 bp Paired-End) 3,000万リード、3Gb DNA:4 μg以上(100 ng/μL以上) 8週間〜 お問合せ
MBD-Seq(100bp Paired-End) 3,000万リード、3Gb DNA:4 μg以上(100 ng/μL以上) 8週間〜 8以上 ¥ 189,000
ChIP-Seq(50 bp Single-Read) ご依頼内容ごとに設定 クロマチン免疫沈降後DNA:100 ng以上(10 ng/μL以上)   お問合せ
ライブラリ調製
● 作業内容:ライブラリ調製
● オプションで品質確認を希望される場合には8サンプル毎に¥15,000の費用が発生します。
解析メニュー 取得データ目安 必要サンプル量 納 期 サンプル数 価格/1サンプル
mRNA-Seq用 納品物は作製済みの
ライブラリーとなります。
total RNA:2 μg以上(40 ng/μL以上) 3週間 8 ¥ 57,000
Total RNA-Seq用 total RNA:2 μg以上(40 ng/μL以上) 3週間 7以上 ¥ 97,000
Human Exome-Seq用 DNA:2 μg以上(100 ng/μL以上) 3週間 8サンプル以上 ¥ 162,000
全ゲノム、Target-Seq用 DNA:2 μg以上(100 ng/μL以上) 3週間 8サンプル以上 ¥ 57,000
シーケンサーラン(レーン貸切)
● 作業内容:シーケンサーラン
● オプションで品質確認を希望される場合には8サンプル毎に¥15,000の費用が発生します。
解析メニュー 取得データ目安 必要サンプル量 納 期 サンプル数 価格/1ラン
NextSeq 75 bp Single-Read 4億リード、最大30Gb 4週間 ¥ 402,000
75bp Paired-End Mid 2.6億リード、最大 19.5Gb ¥ 317,000
150bp Paired-End Mid 2.6億リード、最大39 Gb ¥ 542,000
75 bp Paired-End 8億リード、最大60 Gb ¥ 713,000
150 bp Paired-End 8億リード、最大120 Gb ¥ 1,139,000
MiSeq 150 bp Paired-End 2,700万リード、4 Gb 4週間 ¥ 336,000
250 bp Paired-End 2,700万リード、6.7 Gb ¥ 361,000
300 bp Paired-End 4,700万リード、14.1 Gb ¥ 456,000
150 bp Paired-End Nano 200万リード、300 Mb ¥ 144,000
250 bp Paired-End Nano 200万リード、500 Mb ¥ 174,000
HiSeq 50 bp Single-Read 1.86億リード、9.3 Gb 8週間 ¥ 243,000
3億リード、15 Gb 4週間 ¥ 405,000
100 bp Paired-End 3.74億リード、37.4 Gb 8週間 ¥ 561,000
6億リード、60 Gb 4週間 ¥ 887,000
ライブラリのクオリティチェック
解析メニュー 納期 サンプル量 価格/1サンプル
クオリティチェック(バイオアナライザー) 1週間 8検体ごと ¥ 15,000
濃度測定(定量PCR) 1週間 8検体ごと ¥ 33,000
抗体可変領域解析

5'-RACE法により5'UTRから定常領域までの塩基配列を取得し、シグナル配列部分の開始メチオニンから可変領域の末端部分までの配列を報告します。かずさDNA研究所では大規模cDNAプロジェクトでの経験を生かし、抗体産生細胞からRNA抽出を行い、迅速な可変領域配列の決定を行います。

解析メニュー 納 期 サンプル数 価格/1サンプル
基本解析 3~4週間 1 ¥ 350,000
CDR同定 1~2週間 1 ¥ 21,000

納品物

ロングリード、ゲノム解析、発見解析、エピジェネティクス関連およびランのみ(レーン貸し切り)は、Fastqファイルと作業報告書の入ったDVDまたはHDDを納品します。

ご注文の流れ

  1. 1お問い合わせ・お見積りフォームに必要事項を記入し送信
  2. 2お打ち合わせ、お見積り兼発注書・解析依頼書の受け取り
  3. 3販売店に発注 解析依頼書にサンプル情報を記入し送付(Email)
  4. 4サンプル送付(印刷した解析依頼書を同梱)

サンプル送付方法

  • 必要サンプル量は各メニューの記載をご参照ください。
  • サンプルは必ず抽出したDNAまたはRNAまたは調整済みライブラリ-の状態にして送りください。
    細胞、組織などの状態でのサンプル受け取りはできません。
  • サンプル送付前にサンプル情報を記載した解析依頼書(Excelファイル)をメールにてお送りください。
    サンプル送付時にはプリントアウトした解析依頼書を同梱してください。
  • データ解析のみのご依頼の場合:依頼書記載のサンプル名称と、データにご登録されている名称は統一してください。ヒトサンプルの場合は匿名化をお願いいたします。作業内容ならびにお見積もり内容の確定後にデータをご送付ください。
*これらの送付方法は一例であり、お打ち合わせにて最適な方法をご案内いたします。
サンプル サンプルの状態 送付方法
ゲノムDNA TEまたは市販のDNA抽出キットの溶出液に溶解 保冷剤を同梱し冷凍便
RNA RNaseフリー水または市販のRNA抽出キットの溶出液に溶解 ドライアイスを同梱し冷凍便
ライブラリー 市販のライブラリー調整キットのプロトコールに従って溶解 保冷剤を同梱し冷凍便
抗体産生細胞(ハイブリドーマ) ハイブリドーマをPBS中で2回遠心し、上清を除いて速やかに冷凍したもの ドライアイスを同梱し冷凍便

解析依頼書送付先: otoiawase@kazusagt.com

サンプル送付先

〒292-0818
千葉県木更津市かずさ鎌足2-6-7
株式会社かずさゲノムテクノロジーズ
Tel: 0438-52-2001
*注意:平日に到着するようご指定ください。